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軟件介紹
Beacon Designer官方版是一款非常受歡迎的引物設計輔助軟件。Beacon Designer最新版支持使用基因突變的序列加載到實驗上分析,支持使用DNA引物分析查看實驗數據的變化。Beacon Designer官方版支持在生物分析上擴展數據的變化以及外部分子,支持建立多種基因的序列分析,支持生物鏈的制作以及基因模型制作。
基本簡介
Beacon Designer官方版是一款專為生物實驗相關行業(yè)所打造的設計工具。軟件能夠結合一些化學的公式使用,您可以在分析生物數據的時候加載一些化學的公式到軟件上標注,軟件還能夠將分析的生物數據轉換為基因模型的方式查看。
功能介紹
SYBR? Green 試驗設計
SYBR? Green 可能是實時PCR中最常用的化學分子。BeaconDesigner?可以設計SYBR? Green PCR引物,并且可以幫助您進行前導引物評估。您可以自主控制設計參數或者直接選擇由專家研究和交流后得到的默認值。同時您還可以針對特殊的實驗需要自己設置默認值。除了可以在目的基因的任意位置中定位引物,Beacon Designer 還可以跨內顯子-內顯子或外顯子-外顯子設計引物。跨外顯子內含子連接的引物設計有助于選擇性地從gDNA中擴增得到cDNA。
HRMA 試驗設計
Beacon Designer官方版提供了一個檢測突變的高效方法。相對于以探針為基礎的基因型分析,HRMA更經濟實惠。該軟件運用一種特有的專利的算法,能夠設計出檢測突變的最好引物。
HRMA引物被設計將感興趣的突變設計于最短的擴增子,能夠檢測到解鏈溫度變化。引物避免了模板的二級結構,保證了有效的引物延伸。HRMA引物可以在NCBI上比對核苷酸信息來檢測特異性。此外,預引物和已經發(fā)表的引物同樣可以用來檢測。
雙標簽探針設計
Beacon Designer官方版目前支持基于四種探針的化學反應:
TaqMan 探針
使用Beacon Designe能夠幫助您研究不同基因表達以及單核苷酸多態(tài)性。同樣,您可以選擇LNA替代taqman探針,它比taqman探針更加穩(wěn)定。Beacon Designer?可以幫助您設計甲基化的taqman探針。MethyLight 是一個高通量的分析,用來區(qū)別甲基化和非甲基化的DNA。通過Beacon D
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